Revelado pela Universidad de Chile, Emilio Hernández foi negociado com o futebol mexicano, passou pela Argentina e por fim retornou ao time azul de Santiago de Chile na temporada 2012.
Naquele ano, a La U vinha embalada pelo título da Copa Sul-Americana e tinha Jorge Sampaoli em alta dentro do clube. Apesar da simpatia da torcida por seu futebol, o convívio de Hernández com o treinador não foi dos melhores.
Em conversa com a ESPN, o atacante não poupou Sampaoli de críticas e fez questão de detonar o atual comandante do Atlético-MG .
“Eu pessoalmente não tenho nada de bom para recordar dele. Vejo muita gente da imprensa o comparar com o Bielsa e não entendo, pois são completamente diferentes. O Jorge Sampaoli explora o atleta e, caso vc não se dê bem, ele te troca por outro”, afirmou.
“Não gostei do tratamento que recebi dele. É um dos piores técnicos com os quais já trabalhei e não tenho nada de positivo para falar sobre o seu trabalho”.