A Copa Libertadores de 2012 será disputada por 38 clubes. Na Primeira Fase (preliminar), 12 clubes jogam entre si, em jogos de ida e volta. Os seis classificados passam para a Segunda Fase (de grupos).

Na Segunda Fase, os 32 clubes se dividem em oito grupos com quatro clubes cada. Em cada grupo, os clubes jogam entre si, em jogos de turno e returno. Os dois primeiros colocados avançam para a Fase Final (mata-matas).

A Fase Final começa nas oitavas e vai até a final, sempre com jogos eliminatórios de ida e volta. Nas oitavas-de-final, os confrontos serão divididos assim:
(A) 1º melhor 1º x 8º melhor 2º (B) 2º melhor 1º x 7º melhor 2º (C) 3º melhor 1º x 6º melhor 2º (D) 4º melhor 1º x 5º melhor 2º (E) 5º melhor 1º x 4º melhor 2º (F) 6º melhor 1º x 3º melhor 2º (G) 7º melhor 1º x 2º melhor 2º (H) 8º melhor 1º x 1º melhor 2º

Os oito vencedores passam para as quartas-de-final, com esses cruzamentos:
(S1) Vencedor A x Vencedor H (S2) Vencedor B x Vencedor G (S3) Vencedor C x Vencedor F (S4) Vencedor D x Vencedor E

Os vencedores passam para a semifinal (S1 x S4 e S2 x S3) e, posteriormente, para a final.

Em caso de empate em pontos ganhos nos mata-matas, o desempate será pelos seguintes critérios: a) maior saldo de gols; b) maior número de gols como visitante. Persistindo o empate, a decisão será nos pênaltis, sem prorrogação. Exceto na final haverá prorrogação. Em caso de empate na Segunda Fase (de grupos), desempate será pelos seguintes critérios: a) maior saldo de gols; b) maior número de gols marcados; c) maior número de gols como visitante; d) confronto direto; e) sorteio.

Caso dois clubes de um mesmo país cheguem à semifinal, obrigatoriamente se enfrentarão (se necessário haverá remanejamento de chaves).